Selain itu, sebagai seorang single mother, Nafa juga sibuk mengurus dan merawat anak semata wayangnya. Nafa menikah dengan aktor tampan Zack Lee pada 2007 silam. Dari pernikahannya bersama Zack Lee tersebut, mereka dikarunia seorang anak perempuan yang diberi nama Mikhaela Lee Juwono. Sayangnya, karena sebuah alasan tertentu hubungan Nafa dan Zack harus kandas di tengah jalan.
Mereka pun memutuskan untuk berpisah pada 2017 lalu. Meski telah tak lagi menjadi suami istri, Nafa dan Zack masih tetap berhubungan baik hingga sekarang. Bahkan Nafa tak pernah menghalangi putrinya yang kini berusia 7 tahun itu untuk bertemu dengan sang ayah. Hal tersebut terlihat dari unggahan Nafa baru saja di instagram pribadinya.